O Parque Natural estende-se por 69 773 hectares, abrangendo parte dos concelhos de Mértola e Serpa, num troço de rio que se estende desde uma zona a montante do Pulo do Lobo até à foz da ribeira de Vascão.
As diversas paisagens do Parque Natural estão distribuídas por três grandes estruturas geomorfológicas:
> pelas planícies, predominantes no Parque, onde se encontram as culturas extensivas de sequeiro, as áreas de esteval e os montados de azinho;
> pelas elevações quartzíticas das serras de São Barão e Alcaria; é nesta última que se encontra o ponto mais alto do Parque Natural. Daqui, com apenas 370 m, consegue-se desfrutar de uma panorâmica sobre o relevo suave da planície alentejana e o enrugado resultante da influência próxima da serra algarvia;
> pelos vales encaixados do rio Guadiana e seus afluentes, margeados por escarpas e matagais mediterrânicos. Esta é a formação mais próxima à vegetação original da região, onde hoje em dia se pode encontrar em zonas de difícil acesso (onde a intervenção humana pouco se faz sentir).
À paisagem seca durante o verão, seguem-se os prados verdes do inverno, que vão dando lugar a tonalidades coloridas com a aproximação da primavera. Sujeito às condições de torrencialidade, as ribeiras afluentes do Guadiana ficam praticamente secas, durante os verões mais secos, enquanto que nos invernos mais chuvosos o seu caudal aumenta significativamente.
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